Любая система (или устройство) вредная, если не умеешь ей пользоваться.
Представьте, что вы возьметесь чинить автомобиль, имея весьма смутное (и возможно сильно ошибочное) представление о его устройстве. Может даже вам повезет, и у вас все получится. Но вполне возможно, что ничем хорошим это не кончится. Проблема будет в автомобиле или все таки в вас?

Так это сделали "защиту от блондинок". Чтобы не стирали что ни попадя.
Просто винда постепенно начинает обретать черты полноценной операционной системы. С нормальным разделением прав доступа, и с настроенными по умолчанию ограниченными правами.
В старых версиях винды этого не было. Вы могли невозбранно стирать что угодно. И очень часто люди стирали "ненужные" (как им казалось) файлы и папки, а потом дико удивлялись, что у них не работает комп (и кляли в этом почему-то отнюдь не себя, а Майкрософт и Гейтса лично).

Дело вовсе не в программе. А в наличии у нее прав доступа. Запускайте от имени администратора, и сможете зайти куда угодно. Правой кнопкой по ярлыку программы и "Запуск от имени администратора". Или правой кнопкой, свойства, ярлык, дополнительно, запуск от имени администратора. Это если хотите, чтобы всегда запускалось от имени администратора.
Что касается Explorer. Панель управления, параметры папок, вид. И там внимательно посмотрите на параметры, относящиеся к скрытым и системным папкам и файлам.

з.ы. Кстати, когда в следующий раз не сможете что-то сделать в Винде (или любой другой программе), попробуйте задать вопрос в яндексе. С вероятностью 99% вы получите ответ (иногда решение видно прямо в результатах поиска, даже не надо на сайт переходить).