Все снесенные ветки хранятся вот за этой дверью:

Ключи от двери хранятся вот у этого человека :

Пробраться туда можно только через подводный туннель:

Дальше - прямо по коридору, вторая дверь налево:

Отодвинешь Малдера - и найдешь все веточки в верхнем правом боксе

...