Дорогая леди, все просто, как бутерброд.
Вы стали предметом его эротических фантазий. Можете не сомневаться, что видя Вас (как, впрочем, и не видя), он мысленно имеет Вас всеми возможными и невозможными (хотя я лично таких не знаю) способами. Будучи при этом, вероятно, от природы несколько застенчивым и, скорее всего, скованным в своих явных поступках психологическими тормозами морально-этического характера (этакие, знаете, интеллигентские штучки, коими все мы в разной мере страдаем, но обычно не хотим в этом признаваться себе и окружающим), Ваш шеф, имея некую формальную власть над Вами, прячется за эту самую власть, подменяя ею простое мужчинское стремление заполучить и отыметь понравившуюся ему женщину. Отказать себе в этом "наркотике" он не в силах, и это будет продолжаться до разрешения ситуации с Вашим непосредственным участием. А вот тут вариантов может быть несколько, в зависимости от Вашего собственного отношения к жизни:
1) Он-таки дожидается удобного момента, когда Вы ему отдаетесь:
а) Вас это устраивает, и Вы можете извлечь из этой связи некоторую временную выгоду (временную, т.к. долго это не протянется - надоест либо Вам, либо ему, а прекращенная связь будеть тяготить и работать у него Вы больше не будете)
б) Вас это не устраивает, но Вы на это сознательно идете для "разрешения" ситуации. Тогда отдаваться надо так, чтобы он был разочарован, а после вычеркнуть этот эпизод из памяти начисто, но работать при этом так, чтобы он оставался Вами, как сотрудником. Если при этом Вы никак и ни при каких обстоятельствах не станете ему намекать про "тот" эпизод и не дадите никому повода чего-либо почувствовать, он будет Вам благодарен. Мужчины ценят лояльность по отношению к ним, и женщин, на которых можно положиться. Отношения могут перерасти в неплохую дружбу. Однако такой вариант встречается довольно редко.
в) Он оказывается хорошим любовником, и Вам это нравится. Самый плохой вариант, поскольку работа и секс - несовместимы однозначно и определенно. Означает для Вас большие проблемы в семье и карьере - в случае, если Вы замужем, и просто в карьере - если Вы свободны. Кстати, для него тоже.
2) Секс невозможен категорически ни при каких обстоятельствах: приговор однозначный - увольняйтесь, придумав любую правдоподобную причину, иначе не будет ни жизни, ни карьеры. Причем - не тяните, чем быстрее, тем лучше. Пока он питает к Вам влечение, он не станет делать гадостей, а, наоборот, скорее постарается помочь (даст рекомендации, подержит у себя трудовую, возможно, использует какие-то свои связи и пр.), хотя лучше этой помощью никак не пользоваться, а просто уйти красиво "в никуда".
3) Можно попытаться "подставить" вместо себя подходящую девочку, не имеющую ничего против секса с шефом, обосновав необходимость взятия на работу помощника секретаря и подобрав соответствующую кандидатуру самостоятельно. Самый разумный вариант с точки зрения политики, который может даже значительно упрочить Ваше положение и продвинуть карьеру. Однако я не знаю ни одной женщины, которая пошла бы на такой шаг (в силу особенностей женской психологии).

Очень Вас прошу - поделитесь результатами разрешения Вашей ситуации. Еще лучше, если Вы будете делать небольшие "зарисовки пейзажей" по ходу пьесы - здесь много людей неглупых и опытных, которые помогут Вам дельным советом.

Удачи!

Daddy.