В основном - в нечётко прописанных услових договора, "левых" паспортах съёмщиков, жалобах со стороны соседей, а также стремлением сдающего квартиру мало-мало скрысить НДФЛ... подозреваю, что если на Вашем экземпляре договора не будет отметки налоговой инспекции, то в случае обращения в суд будут проблемы.
В общем, все беды обычно от жадности