Но член от глаза мало отличаецца

ИМХО варианта два:
1. Спектр анибиотика не покрывает возбудителя или его штамм толерантен по какой то причине к лечению. Соответственно необходимо установить возбудителя и его чувствительность к антибиотикам. Вот только вопрос к окулистам-возможно ли это сделать из глазного отделяемого
Возбудителем кроме бактерий могут быть например вирусы, хламидии. (кстати гонококковый тоже бывает, хотя это бактерия

)
2.Есть какая то причина конюнктивита, которая не устранена, соответственно лечение бесполезно. Для примера-аллергия на клеща, живущего в пуху подушки... Может постоянный контакт с объективом камеры и т д.
Необходимо хорошо подумать после чего развился коньюнктивит